ライフサイエンス業界におけるケムインフォマティックスソフトウエアのリーディングプロバイダーChemAxon社は2010年9月1日、独立行政法人理化学研究所　創薬・医療技術基盤プログラムに、同社のInstant JChemをライセンスしたことを発表しました。
Instant JChemは、理研の創薬・医療技術基盤プログラムにおいて、化合物情報の登録およびその共有・解析の支援に利用されます。
Instan Jhemはローカルマシンやサーバーにある化学構造式およびその関連データの管理・活用を行うためのデスクトップアプリケーションです。同製品は、ChemAxonのJChemエンタープライズケモインフォマティックス技術を包含し、他の技術やデータソースとのインテグレーションが可能です。

プレスリリース原文リンク

今日、化学物質の取扱いに関して、様々な法規制へのコンプライアンス対応が求められています。しかしながら、現実にはしばしば改正される法規制へのタイムリーな対応や、生物系試薬、キット品などへの厳密な対応は容易ではありませんでした。

　>>>>法規制チェックシステムCRAIS Checkerの情報はココをクリック

CRAIS Reagentは、試薬情報や在庫情報に対し、メーカーカタログや商用試薬データベース、法規制物質チェックシステムCRAIS Checkerと連携し、最新の法規制情報を容易に管理することができます。

これにより、CRAIS Reagentを用いれば、正確な法規制情報に基づく試薬管理を行うことが出来ます。また、これらの法令情報は、システム上でわかりやすく表示がおこなわれますので、試薬の取扱者全員が法規制情報をより把握し易くなり、コンプライアンス対応や、研究環境の安全性向上が促進されます。

特長

• 毒物、指定薬物、麻薬・向精神薬等の厳重な管理が求められる試薬に関して、使用量記録の強制等、管理方法の指定が可能です。
• 電子保管庫や鍵ボックスを使用する事により、保管庫の開閉履歴が自動で収集出来ます。（オプション）
• 試薬や商品マスターに購入禁止の設定を行う事で、企業ポリシーにより購入を禁止している試薬の購入を防止できます。
• 期末在庫やPRTRの集計が瞬時に行えます。
• 最新のWebアプリ技術を利用し、抜群の使い勝手
• 正確且つ、詳細な構造検索が可能
• ハンディーターミナルの利用
• 電子実験ノート、外部購買サイト、ERPなどの外部システムとの連携

実態に則した、危険物管理（消防法）

• 保管場所毎に管理が可能
• 登録時、移動時等に随時指定数量チェックが可能
• 指定数量をオーバーしている保管場所をＴＯＰ画面にアラート表示
• 適用外の部屋に対して部屋全体の指定数量値を設定する事が可能
• 小量危険物倉庫・危険物倉庫に対しては消防法分類毎の指定数量値を設定する事が可能

Calculator Plugins一覧（詳細は各リンクをクリック)

トートマーを考慮した部分構造検索や、マーカッシュ構造のデータベースを構築・検索など最先端の機能を利用することが可能です。

多様な開発環境に対応（JAVA、NET、WebService利用可能なあらゆる開発言語）しており、APIの使い勝手の良さも好評です。

• JChemBase：様々なRDBMSと組み合わせて利用できるケミストリーエンジン
• JChemCartridge：ORACLEにケミストリーインテリジェンスを付加

CRAIS Browserは化合物情報及び、アッセイ情報、そして計算物性値などの統合検索・参照を実現するWebアプリケーションです。

どんな複雑な検索も、使い勝手の良いクエリービルダーにより簡単に検索条件、表示項目の設定が行えます。

検索結果はSARテーブル形式およびフォーム形式の詳細画面で参照することができます。組み立てた検索条件は保存・共有ができますので、よく利用するビューを即座に表示することができます。

CRAIS Browserでは、想定されるほとんどの検索条件の組み合わせを思い通りに実現することが出来ます。また、「この１週間に登録されたProject Aの化合物に関するSARテーブルを見たい。」といった時間軸による検索も可能です。検索によりヒットしたデータは、簡単にEXCELシートやSDファイルなどに出力することが出来ますので、外部の解析ツールやレポート作成などで利用することが出来ます。

特長

• 構造とアッセイデータ、物性データの複合検索が簡単に行えます。例えば：

• 特定の部分構造を持ち、或るアッセイのIC50が10uM以下の化合物を検索
• 特定の構造に対する類似度が70%以上、かつ或るアッセイのKiが1uM以下。かつカウンターアッセイのKiが100uM以上の化合物を検索
• 特定の部分構造を持たず、LogPが5以下、或るアッセイ値の範囲が1から50uMの化合物を検索検索クエリーを保存したり共有したりする事ができます。

• 検索履歴が自動的に保存されます。
• 検索結果をリスト化し、リスト間の論理演算を行う事ができます。またリストを組織間で共有する事ができます。

CRAIS Registrationは新しいWebアプリケーション技術とChemAxonのケミストリープラットフォームを組み合わせることにより開発された、創薬基幹システムCRAIS シリーズの中核パッケージで、抜群の使い勝手を提供します。

特長

「クリーン」なデータベースの構築のために様々なエラーチェックメカニズムを有しています。

• 描画エラーと思われる構造に対する警告（価数エラー、フラグメント数、チャージなど）　
• 構造の正規化（短縮表記の展開、官能基表記の統一、水素の除去など）　
• 関連データに対しての必須項目設定、フォーマットチェック、ユニークネスチェックなど
• 重複チェックと化合物IDやサンプル（バッチ/ロット）IDなどの自動発番のメカニズムを有しています。　
• 互変異性体を含めた重複チェックを行います。　
• 化合物およびバッチに対して自動発番を行います。

登録を容易にする工夫がなされています。

• テンプレート作成機能
• 最後に登録したデータの呼び出し検索結果の登録画面への貼り付け
• IDの一部による構造の呼び出し
• SDファイルからのバッチ登録自動で物性値を計算しデータベースに登録する事ができます。（オプション）
• フレキシブルなSDファイルからのバッチ登録 

CRAIS Assayはファイザー製薬で開発・運用されていたアッセイデータ管理システムを一般に利用できる形に再構築したシステムで、これらの変更のほとんどに研究現場で対応できるように考慮されたシステムです。

CRAIS Assayで登録されたアッセイデータはCRAIS Browserで構造式や関連データとともに簡単に検索する事ができます。

CRAIS Assayの特徴

• HTS以降のプレートアッセイからADME/Toxアッセイまでのデータ管理に利用できます。
• IT部門の手を借りることなくプロトコル変更などへの対応が可能です。
• サマリーデータが自動的に計算され、ブラウザーで参照可能です。

CRAIS Registration(化合物登録システム）/CRAIS Browser（化学・生物情報統合検索システム）　はWeb2.0時代の新しいWebアプリケーション技術とChemAxonのケミストリーエンジンを組み合わせることにより、使い勝手と汎用性を実現しました。

「 メガファーマの創薬情報システム匹敵する環境が、わずかな期間コストで実現できる。」

法規制チェックシステム「CRAIS Checker」はこの様な問題を解決するために開発され、これまでに製薬・化学企業で約2,000人のユーザーに利用されている国内で最大の利用者を持つ法規制物質チェックシステムですが、この度、公的機関である国立医薬品食品衛生研究所に導入されました。
（公表されている利用事例をお知りになりたい方はinfo@patcore.comまでご連絡下さい。）
 

「CRAIS Checker」は以下の特長を有します。

• 化学構造式から該当する法規制を判定・警告。
• SDファイルなどにより大量の構造式を一括チェック。
• 電子ノート、試薬管理、自社化合物登録システムなどとの連携が容易。
• 広範な法令をサポート。
• 法令改正時の迅速なデータ更新サービス。
• チェック履歴・データ修正履歴を管理。
• 法規制辞書をCAS番号や物質名や別名から検索・参照（あいまい検索対応）

◎CRAIS Checkerの製品情報

本契約において、Aureusは AurSCOPE®の新製品の提供とsanofi-aventisの研究開発部門に導入済みの知識ベースのアップデートを行います。同社の知識ベースはsanofi-aventisの研究者に、GPCR蛋白受容体、核内受容体、キナーゼ、イオンチャネルを含む主要な創薬ターゲットおよび、ADMEのデータを含む薬物安全性に関する情報へのアクセスを提供します。

• プレスリリース全文（英語）
• AureusPharma製品情報
  

• プレスリリース全文（英語）
  
• DDI Predict製品情報
• DDI Predict2009カタログ（PDF）

CRAIS ELNはグローバルな研究組織に対応した多言語対応の電子ノートで、世界に展開する研究メンバーの知識共有とコラボレーションのプラットフォームを提供します。

本電子ノートシステムはAgilent社のKalabie ELNをベースに開発された製品で、著名なメガファーマのグローバル研究組織から少人数のラボまで、様々な規模での導入実績があります。

知的財産権の保護を確実に実現しつつ、ペーパーレス化による効率化を実現する為、電子署名機能を有しています。

CRAIS ELNの特徴

・  Webベースのシンプルで使い易い電子実験ノート

・  大規模な使用環境でも快適なレスポンスで利用可能

・  ペーパーレス化が可能（SAFEや21CFRpart11対応）

適用分野

・  化学合成

・  分析化学

・  生物研究

・  その他

 CRAIS ELNカタログ

• SAR解析支援・ケミスト向け便利ツール「SAR>Vision＋PLUS」
• 化学スプレッドシート　JChem　for　EXCEL
• デスクトップ化学データベース　Instant JChem

本システムは生体内の薬物相互作用を予測するために最先端のアルゴリズムと文献から得られた情報を使用します。
予測結果は薬物相互作用のリスク管理に用いることが出来ます。

主な特長

• 影響を与える薬剤の予測
• 影響を与えられる薬剤の予測
• 最小限の実験パラメータの入力で予測が出来ます。
• 毎分100相互作用以上の迅速な評価が行えます。

DDI PredictはAurSCOPE ADME/DDI の実験情報を利用します。

DDI Predictから以下のグラフィカルな出力ができます。

• FDAクラシフィケーションに基づいた相互作用レポート

• ドーズエフェクトをすばやく確認できるレポート

DDI Predict 2009カタログ(PDF)

多くの医薬品がhERG Channelと相互作用しhERG Channelに関連した心毒性の原因となっているので、医薬品の開発において特にhERG Channelは重要です。
いくつものブロックバスターが、hERGとその関連チャネルに関連する異常によるQT症候群の副作用の為、近年発売中止となりました。AurSCOPE® hERG Channelは詳細な生物学データおよび化合物データを含む知識ベースです。

AurSCOPE® hERG Channelの導入価値

• AurSCOPE® hERG ChannelはhERGチャンネルに関する医薬品候補物質の副作用の予測と理解を可能にします。
• より賢明な化合物の取捨選択と優先順位付けを手助けし、創薬パイプラインの進展に寄与します。

AurSCOPE® ADME/DDIの導入価値

• AurSCOPE® ADME/DDIは潜在的な薬物相互作用の特定を可能にします。
• AurSCOPE® ADME/DDIはリード最適化段階で、早期のADMEに関する問題発見を促進します
• AurSCOPE® ADME/DDIは探索研究と臨床段階の薬剤開発プログラムの両面で重要な情報を提供できるようにデザインされています。
• AurSCOPE® ADME/DDIは研究開発のプロジェクトマネジメントにおいて豊富な情報に基づく、戦略的な意思決定を容易にします。

AurSCOPE ADME ケーススタディー(PDF)

AurSCOPER® Ion Channelの導入価値

• AurSCOPE® Ion Channelを用いると、研究者がイオンチャンネルに関する最新情報へ迅速にアクセスできるようになります。
• AurSCOPE® Ion Channelは豊富な情報にもとづき、より的確にリード化合物の優先順位づけや選別を行うことを可能にし、探索パイプラインの前進に寄与します。

ケーススタディー：Bridging Chemical and Biological Realms:
an Ion Channel/Ligand Case Study（PDF）

全ての主なキナーゼファミリーが含まれています。

それは、公開された薬理化学研究の化合物情報や生物学的データを辞書に基づき徹底的に整理した知識ベースと、あらゆる視点から迅速に検索・解析が可能な検索システムが統合された、唯一のシステムです。

• 独自に開発したナレッジマネジメントプラットフォーム
• 創薬標的毎に整理されたデータ
• 継続的なコンテンツのアップデート
• Webベースの検索ツール
• 強力な予測機能

Aureus Pharmaのナレッジマネジメントシステム

AurSCOPE®（オールスコープ）は医薬標的あるいは創薬上のテーマに関する関連する生物学的および化学的情報を含む完全な注釈が付けられた知識データベースです。

現在以下の知識ベースがリリースされております。(クリックで詳細表示)

• AurSCOPE® GPCR （G蛋白質共役型受容体リガンド）
• AurSCOPE® Kinase （キナーゼリガンド）
• AurSCOPE® Ion Channels （イオンチャンネルリガンド）
• AurSCOPE® ADME/Drug-Drug Interactions （薬物動態/薬物薬物相互作用情報）
• AurSCOPE® hERG Channel （hERGチャネル阻害）

AurSCOPE®の特長

• 関連する特許や科学ジャーナルからの広範なソース文献のアノテーションを網羅
• in vitroおよびin vivo実験由来の生物学データ、化学情報、構造活性相関の完全なカバレッジ
• 関連する特許や科学ジャーナルからの広範なソース文献のアノテーションを網羅
• in vitroおよびin vivo実験由来の生物学データ、化学情報、構造活性相関の完全なカバレッジ
• コンテンツの定期的なアップデートを提供
• 高品質なデータの参照
• 文脈にそった情報構造を提供
• 標準化された用語および定義のシソーラス辞書を搭載
• クロスリファレンスによる相互参照とシノニムよるマッチング
• 強力なクエリーツール
• 用語のマネジメントツール
• データ一貫性を確認する為のルールベースのプロトコルを搭載

AurSTORER®（オールストア）はAureusの包括的なデータ構造化システムで、創薬ナレッジを管理する為にデザインされています。
AurSTORE®は通常のデータベースを凌駕するもので、Aureusによって設計された辞書と用語集を使用することで複雑な実験データをオーガナイズします。
AurSTOREは自社データであれ、外部から入手したデータであれ、どんなソースからのデータも徹底的にオーガナイズします。

AurQUEST®（オールクエスト）はパワフルなWebベースの検索システムで、構造式や物性などの化学的な条件や活性値などの生物学的条件から詳細な検索を可能にします。
AurQUESTを用いることにより、研究者はより早く薬理化学的な理解を深めることができます。

AurTABLE®（オールテーブル）は多次元の構造活性相関(SAR)テーブルで、AurQUESTの検索結果をまとめより高度な解析機能を提供します。
目的に応じてテーブルレイアウトを迅速に変更でき、効率的かつ迅速な解釈が可能になります。

DDI Predict®（ディー・ディー・アイ・プレディクト）は生体内の薬物相互作用を予測するために最先端のアルゴリズムと文献から得られた情報を使用します。
予測結果は薬物相互作用のリスク管理に用いることが出来ます。

ChemSABREは構造活性相関（SAR)における置換基の置き換えパターンを解析する為に開発されたデスクトップアプリケーションです。

R×Rグループ表を表示し、各セルに任意のプロパティー値（あるいはそれらの統計値）に基づく着色を行いヒートマップ（heatmap）が作成できます。

また、その表から化合物が存在しないポジションの全ての構造を自動的に発生 (hole enumeration).させることができます。

ChemSABREにはバイオアイソステリックな置換基（bioisosteric replacements）として報告されたフラグメント、およびsteric,entropic,electronic propertiesに基づき選択された計算に基づくフラグメントのデータベースが付属します。テーブル上の任意の置換基上でマウス操作をするだけでそのフラグメントに対するバイオアイソステリックな置換基の一覧を表示することができ、構造展開のイマジネーションを活性化することができます。

ChemSABREの特長

• Rグループ対Rグループテーブルの構築
• 化合物が存在しない置換基の組み合わせをエニュメレート
• Rグループ対Rグループのプロパティーのプロット
• 官能基のバイオアイソステリックな組み合わせの表示

ChemSABREカタログダウンロード（英文）

ChemASPの特長

• １原子の置換の識別を行う詳細な抽出から、リング構造のみの抽出まで、目的に応じた骨格抽出が行えます。
• 抽出結果はSDファイルとして出力できる他、SARvisionPlusフォーマットで出力することができます。
• ChemASPはコマンドラインツールで、バッチファイルを利用した自動化やPipelinePilotなどと組み合わせたインテグレーションが可能です。
• ChemASPは大量のデータの高速処理を可能にするため、32bit版に加え、64bit版も用意されております。プラットフォームはWindowsおよび Linux (Suze またはRedhat) をサポートしております。

ChemASPカタログダウンロード（英文）

今日、法令等の遵守は重要な経営課題の一つとなっております。万一法令に違反した場合、刑事罰や行政制裁に加え、企業イメージの悪化や売上の落ち込みなど、経営に大きな影響を及ぼす可能性があります。化合物を取り扱う企業において、規制化合物を適正に取り扱う事はコンプライアンスの観点から非常に重要ですが、規制化合物は多種多様であり、各組織において化合物を取り扱う全ての人が全ての規制化合物を把握する事は現実的ではありません。
CRAIS Checkerはこのような問題を解決するソフトウェアです。CRAIS Checkerでは規制法令に該当する構造が簡単に特定できますので、組織内での化合物の適正管理を推進することができます。

CRAIS Checkerの特長

• 高精度・高速な判定アルゴリズム
• 規制構造を漏らさずチェックし、ノイズ（誤判定）を極小化しています。

• 試薬管理システムCRAIS Reagentとのシームレスな連係
• キット品管理など最新の薬品管理機能を有するシステムで、CRAIS Checkerと連動し、在庫試薬や試薬カタログの法規制チェックが行えます。法改正などへの対応はより確実・簡単に行えます。

　>>>>薬品管理システムCRAIS Reagentの情報はココをクリック

• 充実した規制データベース。

以下の規制に対応しています。

• 麻薬及び向精神薬取締法
• 覚せい剤取締法
• 薬事法
• 毒物及び劇物取締法
• 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律
• 労働安全衛生法
• 輸出貿易管理令
• 農薬取締法
• 化学兵器の禁止及び特定物質の規制等に関する法律
• ロッテルダム条約
• 水質汚濁防止法

• 法令等の改正時には規制データベースのアップデートを行います。
• 対応する法令等を随時拡大しています。
• 履歴管理
• いつ、だれが、どの構造式をチェックし、その結果が どうであったのかが、履歴として保存されます。
• チェック証明書が発行されます。
• 外部システムとの連携
• SOA（サービス指向アーキテクチャ）の採用により、電子実験ノートや試薬管理システム等の外部システムとの連携が容易です。例えば電子ノートとの連携では、合成計画立案時点で規制化合物か否かのチェックを自動化することが可能です。ケンブリッジソフト社のE-Notebookなどとの大規模な連係実績がございます。
• チェックする法令を選択可能
• 例えば電子ノートからの問い合わせには劇物を含まない、試薬管理システムからの問い合わせは劇物をチェックする、などのように業務によってチェックする法令が選択できます。

 

 



CRAIS Checkerカタログ 

 

CRAIS Checker利用事例

「電子実験ノートにおける法規制対応」, エーザイ株式会社　江藤 宏範　様
 日本化学会情報化学部会誌,Vol. 26, 162 (2009)

 

独自の最大共通部分構造(MCS: Maximum Common Substructure) 抽出エンジンにより化学構造データを骨格ごとに分類することができ、SARの検討を容易にします。

骨格は予めリストとして与える必要はなく、読み込まれた化学構造式から自動的に生成されます。

骨格ベースのデータマイニングは、記述子ベースのクラスタリングに比べて化学者の感性に近い評価が行え、スクリーニングデータの評価やHit to Leadやリード最適化ステージでの合成戦略の立案などに力を発揮します。

SARvisionPlusの特長

• 構造式群から自動的に骨格を抽出・認識、SAR的に整理されていない化学構造データを自動的に骨格ごとに分類します。
• 骨格をリングサイズや原子数などで絞り込みが行えます。・活性データなどでソート、絞込みが可能です。
• 共通構造と置換基を整理しRグループテーブルを瞬時に作成します。
• RグループテーブルをEXCELやWORDへ出力し効率的にポートを作成します。・コマンドラインオプションをサポートしており、他のソフトウエアとの連携も可能です。
• 物性値を計算し、活性値と共に迅速にグラフ化します。（構造情報とリンク）

SARvisionPlusカタログダウンロード（英文）

全社的な規制対応への取り組みを支援

SD Checker Enterpriseは企業レベルの法規制構造チェックに対応するため、SOA（サービス指向アーキテクチャ）を採用し電子実験ノートや試薬管理システム等の外部システムとの連携を容易に実現します。外部システムから構造チェック要求を受信すると即座に判定し、チェック結果を応答します。これにより、合成計画立案時や発注処理の過程で警告を発し、違法となる行為を防止します。

主要な国内法規制データベースを標準装備

SD Checker Enterpriseには専用の規制データベースが付属します。規制データベースには「麻薬及び向精神薬取締法」、「覚せい剤取締法」、「指定薬物」、「毒物及び劇物取締法」、「輸出貿易管理令」をカバーしており、すぐにご利用頂けます。また、ユーザー自身で規制データを登録して頂くことも可能です。
弊社では、規制データのアップデートサービス、お客様個別のご要望に対応した規制データベースの構築サービスもご提供しております。

会社概要

名称：パトコア株式会社
本社住所：東京都江東区有明3-1-25有明フロンティアビルB棟9階
代表者：取締役　藤木雅己
ホームページ:http://www.patcore.com

【本件に関するお問い合わせ先】
担当者：有賀(あるが)
TEL：03-5530-9242
E-mail：info@patcore.com

仕事内容

化学情報システムの営業
化学情報システムに関するコンサルティング及びサポート業務
化学情報システムのドキュメント作成

求める経験・スキル

科学系システムの開発/運用
英語力（英検2級程度）

勤務地

東京（在宅勤務相談可）

雇用形態

１）正社員、２）契約社員、パートタイムなどご相談に応じます。

休日/休暇

休日：完全週休二日制（土曜日、日曜日）、祝日、年末年始
休暇（正社員）：有給休暇、各種慶弔休暇など

給与

経験・能力に基づき優遇いたします

応募資格

年齢：35歳位まで

お問合せは、 info@patcore.comまでお願いします。