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化学・生物情報統合検索システムCRAIS Browser(クレイスブラウザー)
必要な情報を、必要な形で簡単に検索・参照・取り出しが行える環境を提供します。
CRAIS Browserは化合物情報及び、アッセイ情報、そして計算物性値などの統合検索・参照を実現するWebアプリケーションです。
どんな複雑な検索も、使い勝手の良いクエリービルダーにより簡単に検索条件、表示項目の設定が行えます。
検索結果はSARテーブル形式およびフォーム形式の詳細画面で参照することができます。組み立てた検索条件は保存・共有ができますので、よく利用するビューを即座に表示することができます。
CRAIS Browserでは、想定されるほとんどの検索条件の組み合わせを思い通りに実現することが出来ます。また、「この1週間に登録されたProject Aの化合物に関するSARテーブルを見たい。」といった時間軸による検索も可能です。検索によりヒットしたデータは、簡単にEXCELシートやSDファイルなどに出力することが出来ますので、外部の解析ツールやレポート作成などで利用することが出来ます。
特長
- 構造とアッセイデータ、物性データの複合検索が簡単に行えます。例えば:
- 特定の部分構造を持ち、或るアッセイのIC50が10uM以下の化合物を検索
- 特定の構造に対する類似度が70%以上、かつ或るアッセイのKiが1uM以下。かつカウンターアッセイのKiが100uM以上の化合物を検索
- 特定の部分構造を持たず、LogPが5以下、或るアッセイ値の範囲が1から50uMの化合物を検索検索クエリーを保存したり共有したりする事ができます。
- 検索履歴が自動的に保存されます。
- 検索結果をリスト化し、リスト間の論理演算を行う事ができます。またリストを組織間で共有する事ができます。
更新日:2010年1月19日 | 本記事のURL
化合物登録システムCRAIS Registration(クレイスレジストレーション)
創薬の要、化合物登録システムを迅速に構築。
CRAIS Registrationは新しいWebアプリケーション技術とChemAxonのケミストリープラットフォームを組み合わせることにより開発された、創薬基幹システムCRAIS シリーズの中核パッケージで、抜群の使い勝手を提供します。
特長
「クリーン」なデータベースの構築のために様々なエラーチェックメカニズムを有しています。
- 描画エラーと思われる構造に対する警告(価数エラー、フラグメント数、チャージなど)
- 構造の正規化(短縮表記の展開、官能基表記の統一、水素の除去など)
- 関連データに対しての必須項目設定、フォーマットチェック、ユニークネスチェックなど
- 重複チェックと化合物IDやサンプル(バッチ/ロット)IDなどの自動発番のメカニズムを有しています。
- 互変異性体を含めた重複チェックを行います。
- 化合物およびバッチに対して自動発番を行います。

登録を容易にする工夫がなされています。
- テンプレート作成機能
- 最後に登録したデータの呼び出し検索結果の登録画面への貼り付け
- IDの一部による構造の呼び出し
- SDファイルからのバッチ登録自動で物性値を計算しデータベースに登録する事ができます。(オプション)
- フレキシブルなSDファイルからのバッチ登録
更新日:2010年6月16日 | 本記事のURL
化合物登録システム/化学・生物情報統合検索システム導入事例
化合物情報登録システムは、これまで多額の費用を投じて徹底的に作りこみを行わなければ実用的なシステムを構築することはできませんでした。また、それでも化学系および生物系研究者、そして研究マネジメントの皆様が十分満足する使い勝手を提供することは非常に難しいのが現実でした。
CRAIS Registration(化合物登録システム)/CRAIS Browser(化学・生物情報統合検索システム) はWeb2.0時代の新しいWebアプリケーション技術とChemAxonのケミストリーエンジンを組み合わせることにより、使い勝手と汎用性を実現しました。
「 メガファーマの創薬情報システム匹敵する環境が、わずかな期間コストで実現できる。」
更新日:2010年6月18日 | 本記事のURL