創薬支援のパトコア(Patcore) tag:,2008-02-11:/1 2008-07-28T01:33:15Z 創薬支援のパトコア Movable Type Open Source 4.1 ケモインフォマティックス・ソリューション tag:www.patcore.com,2008://1.121 2008-06-10T16:16:54Z 2008-06-10T16:50:49Z パトコアはUnmet Chem-infomatics needsの解消に向け、投資対効果の最大化を実現するケモインフォマティックスソリューションの開発に取り組んでおります。現在以下のケモインフォマティックスソリューションを提供しております。 admin パトコアはUnmet Chem-infomatics needsの解消に向け、投資対効果の最大化を実現するケモインフォマティックスソリューションの開発に取り組んでおります。現在以下のケモインフォマティックスソリューションを提供しております。

エンタープライズソリューション

デスクトップソリューション

データコンテンツ

]]> CRAIS 化合物管理システム tag:www.patcore.com,2008://1.120 2008-06-10T15:25:01Z 2008-06-10T16:11:15Z CRAISはWeb2.0時代の新しいWebアプリケーション技術とChemAxonのケミカルインテリジェンスを組み合わせることにより、新次元の使い勝手と汎用性を実現しました。 admin CRAISは次世代の化合物登録管理システムです。

今までは、莫大な費用を投入して徹底的に作りこみを行わなければ実用的な化合物登録システムを構築することはできませんでした。また、莫大な費用を投入したとしても、化学者および生物学者、そして研究マネジメントの皆様が十分満足する使い勝手を提供することは非常に難しいのが現実でした。

CRAISはWeb2.0時代の新しいWebアプリケーション技術とChemAxonのケミカルインテリジェンスを組み合わせることにより、新次元の使い勝手と汎用性を実現しました。

一例としてCRAISには次のような機能があります。

  • 合成化学者が化合物を迅速且つ正確に登録できる機能を提供しています。
  • SARの解析を行う場合には、テーマや標的などにより迅速に必要なデータセットをEXCELやSDファイルにダウンロードできます
  • CRAISはコーポレートのアッセイデータベースと統合ができます。登録されたアッセイデータは、構造式や物性とともに、アッセイデータを指定した検索が簡単にできるようユーザーフレンドリーなナビゲーションを提供します。
  • 検索条件やリストは保存できるだけなく、研究チームで共有することができスムーズなコラボレーションを支援します。
  • 化合物の登録状況やそれらのアッセイ状況がリアルタイムで把握できるレポーティング機能により、研究マネジメントの意思決定を支援します。

 

 crains_outline1jpg.jpg

crais_screen1.jpg詳細・デモンストレーションについてはパトコアまでお問い合わせ下さい。

]]> <![CDATA[DDI Predict®：薬物相互作用予測システム]]> tag:www.patcore.com,2008://1.119 2008-06-07T16:49:25Z 2008-06-25T05:13:23Z DDI Predictは、貴社のリード候補物質と何百もの医薬品の薬物相互作用を迅速且つ正確に予測します。 admin DDI Predict®は、貴社のリード候補物質と何百もの医薬品の薬物相互作用を迅速且つ正確に予測します。


本システムは生体内の薬物相互作用を予測するために最先端のアルゴリズムと文献から得られた情報を使用します。
予測結果は薬物相互作用のリスク管理に用いることが出来ます。

主な特長

  • 影響を与える薬剤の予測
  • 影響を与えられる薬剤の予測
  • 最小限の実験パラメータの入力で予測が出来ます。
  • 毎分100相互作用以上の迅速な評価が行えます。
 

main_ddi.jpgDDI PredictはAurSCOPE ADME/DDI の実験情報を利用します。

DDI Predictから以下のグラフィカルな出力ができます。

  • FDAクラシフィケーションに基づいた相互作用レポート
    • calculation_DDI_v2_ps.png
  • ドーズエフェクトをすばやく確認できるレポート
    • dose_effect_DDI_v2_ps.png
]]> <![CDATA[AurSCOPER® hERG Channel：hERGチャンネルデータベース]]> tag:www.patcore.com,2008://1.118 2008-06-07T16:25:58Z 2008-06-25T05:11:44Z AurSCOPER hERG Channel（オールスコープハーグチャンネル）はhERG (ハーグ：human Ether-a-go-go Related Gene) チャンネルに関する生物的および化学的情報を徹底的に整理した知識ベースです。 admin AurSCOPE® hERG Channel（オールスコープハーグチャンネル）はhERG (ハーグ：human Ether-a-go-go Related Gene) チャンネルに関する生物的および化学的情報を徹底的に整理した知識ベースです。

多くの医薬品がhERG Channelと相互作用しhERG Channelに関連した心毒性の原因となっているので、医薬品の開発において特にhERG Channelは重要です。
いくつものブロックバスターが、hERGとその関連チャネルに関連する異常によるQT症候群の副作用の為、近年発売中止となりました。AurSCOPE® hERG Channelは詳細な生物学データおよび化合物データを含む知識ベースです。

 

Graph_hERG_new.pngAurSCOPE® hERG Channelの導入価値

  • AurSCOPE® hERG ChannelはhERGチャンネルに関する医薬品候補物質の副作用の予測と理解を可能にします。
  • より賢明な化合物の取捨選択と優先順位付けを手助けし、創薬パイプラインの進展に寄与します。
]]> <![CDATA[AurSCOPER® ADME/DDI :ADME・薬物相互作用データベース]]> tag:www.patcore.com,2008://1.117 2008-06-05T05:00:45Z 2008-06-25T05:09:18Z AurSCOPER ADME/DDI (Drug-Drug Interactions)は完全な注釈がつけられ、構造化された知識データべースで、薬物代謝に関連する詳細な生物学的および化学的な情報を含んでいます。 admin AurSCOPE® ADME/DDI (Drug-Drug Interactions)は完全な注釈がつけられ、構造化された知識データべースで、薬物代謝に関連する詳細な生物学的および化学的な情報を含んでいます。このAurSCOPE® ADME/DDI は潜在的な薬物相互作用の識別に大変有用であることが証明されています。

Graph_DDI_new.pngAurSCOPE® ADME/DDIの導入価値

  • AurSCOPE® ADME/DDIは潜在的な薬物相互作用の特定を可能にします。
  • AurSCOPE® ADME/DDIはリード最適化段階で、早期のADMEに関する問題発見を促進します
  • AurSCOPE® ADME/DDIは探索研究と臨床段階の薬剤開発プログラムの両面で重要な情報を提供できるようにデザインされています。
  • AurSCOPE® ADME/DDIは研究開発のプロジェクトマネジメントにおいて豊富な情報に基づく、戦略的な意思決定を容易にします。
]]> <![CDATA[AurSCOPE® Ion Channel:イオンチャンネルリガンドデータベース]]> tag:www.patcore.com,2008://1.116 2008-06-04T04:40:47Z 2008-06-25T05:07:00Z AurSCOPER Ion Channelはイオンチャンネルのリガンドに関する包括的なデータベースで、イオンチャンネル遮断薬、オープナー、またはアクチベーターに関する薬剤にフォーカスしています。 admin AurSCOPE® Ion Channelはイオンチャンネルのリガンドに関する包括的なデータベースで、イオンチャンネル遮断薬、オープナー、またはアクチベーターに関する薬剤にフォーカスしています。 この包括的な知識ベースは、カルシウム、塩素、カリウム、ナトリウムのイオンチャンネルおよびトランスミッターゲートでコントロールされるイオンチャンネルを含む全てのイオンチャネルの情報を含みます。
AurSCOPE® Ion Channelは化合物情報をはじめ、徹底的に整理された生物学情報を提供します。

Graph_ION_new.png

AurSCOPER® Ion Channelの導入価値

  • AurSCOPE® Ion Channelを用いると、研究者がイオンチャンネルに関する最新情報へ迅速にアクセスできるようになります。
  • AurSCOPE® Ion Channelは豊富な情報にもとづき、より的確にリード化合物の優先順位づけや選別を行うことを可能にし、探索パイプラインの前進に寄与します。
]]> <![CDATA[AurSCOPE® KINASE :キナーゼリガンド情報データベース]]> tag:www.patcore.com,2008://1.115 2008-06-04T02:46:19Z 2008-06-25T05:04:58Z キナーゼとそれらのリガンドに関する包括的な知識ベース。 admin Aureus Pharmaはキナーゼとそれらのリガンドに関する包括的な知識ベースを構築しました。キナーゼは最も重要な創薬ターゲットの一つで、キナーゼ阻害剤はがんや慢性の炎症、代謝疾患をはじめとする多くの病気の治療薬として使われています。

Graph_KINASE_new.png全ての主なキナーゼファミリーが含まれています。 SAR_treeView.png

SAR_treeView_dp.png]]> <![CDATA[AurSCOPE® GPCR：GPCRリガンド情報データベース]]> tag:www.patcore.com,2008://1.113 2008-06-04T02:33:37Z 2008-06-25T05:03:24Z AurSCOPE GPCRは、GPCR（G蛋白質共役型受容体）に作用するリガンドの生物学的情報、物理化学的情報の完全な注釈が付けられたデータベースです。 admin AurSCOPE® GPCRは、GPCR（G蛋白質共役型受容体）に作用するリガンドの生物学的情報、物理化学的情報の完全な注釈が付けられたデータベースです。

Graph_GPCR_new.png

AurSCOPE® GPCRの導入価値

  • AurSCOPE® GPCRはリード最適化プログラムの方向づけを可能にします。
  • AurSCOPE® GPCRはスクリーニングの為の最適なフォーカスドライブラリーの特定を可能にします。
  • AurSCOPE® GPCRは新規に特定された受容体の迅速なキャラクタライゼーションを可能にします。
  • AurSCOPE® GPCRは豊富な情報に基づく戦略的なプロジェクトの意思決定を容易ににします。
]]> Aureus Pharma社の創薬知識ベース tag:www.patcore.com,2008://1.111 2008-06-03T15:00:00Z 2008-06-25T05:01:49Z Aureus社の知識データベースシステム「AurSCOPE」は、GPCR、キナーゼ、イオンチャンネルなどの創薬標的に対するリガンドの情報を文献などから徹底的に整理・組織化し、多角的な検索が迅速にできる検索システムと統合。 admin aureus_logo.gifAureus Pharma（オーリアスファーマ）は創薬研究における知識創造の為に、専門分野別のユニークなソリューションを提供します。

それは、公開された薬理化学研究の化合物情報や生物学的データを辞書に基づき徹底的に整理した知識ベースと、あらゆる視点から迅速に検索・解析が可能な検索システムが統合された、唯一のシステムです。

image_product_over.jpg
  • 独自に開発したナレッジマネジメントプラットフォーム
  • 創薬標的毎に整理されたデータ
  • 継続的なコンテンツのアップデート
  • Webベースの検索ツール
  • 強力な予測機能

Aureus Pharmaのナレッジマネジメントシステム

AurSCOPE®（オールスコープ）は医薬標的あるいは創薬上のテーマに関する関連する生物学的および化学的情報を含む完全な注釈が付けられた知識データベースです。

現在以下の知識ベースがリリースされております。(クリックで詳細表示)

AurSCOPE®の特長

  • 関連する特許や科学ジャーナルからの広範なソース文献のアノテーションを網羅
  • in vitroおよびin vivo実験由来の生物学データ、化学情報、構造活性相関の完全なカバレッジ
  • 関連する特許や科学ジャーナルからの広範なソース文献のアノテーションを網羅
  • in vitroおよびin vivo実験由来の生物学データ、化学情報、構造活性相関の完全なカバレッジ
  • コンテンツの定期的なアップデートを提供
  • 高品質なデータの参照
  • 文脈にそった情報構造を提供
  • 標準化された用語および定義のシソーラス辞書を搭載
  • クロスリファレンスによる相互参照とシノニムよるマッチング
  • 強力なクエリーツール
  • 用語のマネジメントツール
  • データ一貫性を確認する為のルールベースのプロトコルを搭載

AurSTORER®（オールストア）はAureusの包括的なデータ構造化システムで、創薬ナレッジを管理する為にデザインされています。
AurSTORE®は通常のデータベースを凌駕するもので、Aureusによって設計された辞書と用語集を使用することで複雑な実験データをオーガナイズします。
AurSTOREは自社データであれ、外部から入手したデータであれ、どんなソースからのデータも徹底的にオーガナイズします。

AurQUEST®（オールクエスト）はパワフルなWebベースの検索システムで、構造式や物性などの化学的な条件や活性値などの生物学的条件から詳細な検索を可能にします。
AurQUESTを用いることにより、研究者はより早く薬理化学的な理解を深めることができます。

AurTABLE®（オールテーブル）は多次元の構造活性相関(SAR)テーブルで、AurQUESTの検索結果をまとめより高度な解析機能を提供します。
目的に応じてテーブルレイアウトを迅速に変更でき、効率的かつ迅速な解釈が可能になります。

DDI Predict®（ディー・ディー・アイ・プレディクト）は生体内の薬物相互作用を予測するために最先端のアルゴリズムと文献から得られた情報を使用します。
予測結果は薬物相互作用のリスク管理に用いることが出来ます。

    ]]>     「ChemAxon事例紹介セミナー」のご案内 tag:www.patcore.com,2008://1.110 2008-05-24T14:45:05Z 2008-05-26T14:09:21Z ケムインフォマティックス製品の事例紹介セミナーを2008年6月24日大坂、6月27日東京で開催。ChemAxonのユーザ様より化学情報基盤の構築事例、規制物質チェックシステムの導入事例の講演を予定しています。 admin 次世代化学情報インフラの構築・法規制物質のコンプライアンス対応強化

    拝啓、貴社益々ご清栄の事とお喜び申し上げます。

    この度ChemAxon社のCheminformatics製品の事例紹介セミナーを下記要領にて開催させて頂きます。
    ChemAxon社製品は欧米の製薬・化学会社、アカデミック研究機関で広く利用されており、国内におきましても着実に導入実績が増えております。
    本セミナーでは、ユーザ様より利用事例をご発表いただき、関連する製品をデモンストレーションを交えて紹介させて頂きます。
    ご多用中とは存じますが、是非ご参加下さいますようお願い申し上げます。

    敬具

    [PDF版セミナーご案内状ダウンロード]

    要領

    日時
    大阪会場：6月24日（火）12:50～18:20　懇親会 18:30～20:30
    東京会場：6月27日（金）12:50～18:20　懇親会 18:30～20:30
    場所
    大阪会場：大阪マルビル　大阪第一ホテル6階 [地図]
    東京会場：六本木アカデミーヒルズ（六本木ヒルズ49階） [地図]
    参加費・申込み
    無料。事前登録が必要です。
    定員になり次第締め切りますのでお早めにお申込ください。
    セミナー参加申し込みフォームよりお申し込みください。
    主催
    パトコア株式会社

    プログラム

    12:30
    受付開始
    12:50-13:00
    ご挨拶
    13:00-13:40
    招待講演
    「大手製薬会社スピンオフベンチャーにおける研究支援システムの構築」
    演者未定
    13:40-14:10
    CRAIS 化合物管理システムのご紹介
    14:10-14:40
    InstantJChemのご紹介
    14:40-15:00
    -休憩-
    15:00-15:30
    Markush検索機能のご紹介
    15:30-17:00
    パートナープレゼンテーション
    ・「SpotfireとJChemの統合機能」
    　Spotfire　大石尚孝 様
    ・「アッセイデータ管理システム HitProfiler」
    　Genedata　下広英樹 様
    ・「試薬管理システム Chemical Design」
    　（株）インフォグラム 麻生英輝 様
    ・「Aureusリガンドデータベースご紹介」
    　パトコア（株）
    17:00-17:10
    -休憩-
    17:10-17:50
    招待講演
    「塩野義製薬における規制物質チェックシステムの構築と運用」
    塩野義製薬（株）研究本部　竹中秀行 様
    17:50-18:10
    SD Checker Enterprise 法規制チェックシステムご紹介
    18:10-18:20
    全体質疑応答
    18:30-20:30
    懇親会

    お問い会わせ

    パトコア株式会社
    TEL:03-5530-9242
    E-mail：seminar@chemaxon.jp
    担当：有賀

    ]]>     ChemSABRE :官能基置換パターン解析ツール tag:www.patcore.com,2008://1.105 2008-04-12T01:58:21Z 2008-04-12T05:26:06Z 構造活性相関（SAR)における置換基の置き換えパターン解析用ソフト admin chemsasabre.jpg

    ChemSABRE（ケム・セーバー）は構造活性相関（SAR)における置換基の置き換えパターンを解析する為に開発されたデスクトップアプリケーションです。R×Rグループ表を表示し、各セルに任意のプロパティー値（あるいはそれらの統計値）に基づく着色を行いヒートマップ（heatmap）が作成できます。

    また、その表から化合物が存在しないポジションの全ての構造を自動的に発生 (hole enumeration).させることができます。

    ChemSABREにはバイオアイソステリックな置換基（bioisosteric replacements）として報告されたフラグメント、およびsteric,entropic,electronic propertiesに基づき選択された計算に基づくフラグメントのデータベースが付属します。テーブル上の任意の置換基上でマウス操作をするだけでそのフラグメントに対するバイオアイソステリックな置換基の一覧を表示することができ、構造展開のイマジネーションを活性化することができます。

    ChemSABRE機能一覧

    • Rグループ対Rグループテーブルの構築
    • 化合物が存在しない置換基の組み合わせをエニュメレート
    • Rグループ対Rグループのプロパティーのプロット
    • 官能基のバイオアイソステリックな組み合わせの表示
    ]]>     ChemASP:最大共通部分構造（MCS）抽出エンジン tag:www.patcore.com,2008://1.103 2008-01-01T06:16:00Z 2008-04-13T05:50:55Z 最大共通部分構造（MCS：Maximum Common Substructure）アルゴリズム admin ChemASPはメディシナルケミストの感性に近い骨格を自動抽出する、独自の最大共通部分構造（MCS：Maximum Common Substructure）アルゴリズムを搭載した解析エンジンで、大容量の化学データベースから階層型のMCSを抽出し、骨格に基づいたクラスタリングやケモタイプの同定が行えます。

    scaffold_tree.jpg
    • １原子の置換の識別を行う詳細な抽出から、リング構造のみの抽出まで、目的に応じた骨格抽出が行えます。
    • 抽出結果はSDファイルとして出力できる他、SAR>visionのネイティブフォーマットで出力することができます。
    • ChemASPはコマンドラインツールで、バッチファイルを利用した自動化やPipelin Pilotなどと組み合わせたインテグレーションが可能です。
    • ChemASPは大量のデータの高速処理を可能にするため、32bit版に加え、64bit版も用意されております。プラットフォームはWindowsおよび Linux (Suze またはRedhat) をサポートしております。

    MCS抽出パラメータの設定例

    Strict Match = 0; # set this to 0
    Partial Resonance = 1; # set this to 1.
    BuildAll = 1; # Build all layers Minimum Threshold = 3;# smallest family
    Sampling Size = 100; # dataset sampling
    Delete Trivial = 1; # no trivial
    ID Relevant Chains = 1; # acyclic fragments
    Atom By Atom = 0; # build atom by atom
    SimplifiedRingsOnly = 0; Name Scaffolds = 1; # Autoname scaffolds Name Scaffolds(uniquely) = 0;
    #Name Field = "ID"; # Name Field for sdf InputSDF = "./LibraryExample.sdf";
    Name Field = "MID";

    ]]>     サポート tag:patcore.chemaxon.jp,2008://1.50 2008-01-01T00:57:36Z 2008-03-29T13:34:22Z 各製品のサポート情報・ダウンロード情報を掲載しています。 ご利用にはユーザ様専用のIDとパスワードが... admin 各製品のサポート情報・ダウンロード情報を掲載しています。
    ご利用にはユーザ様専用のIDとパスワードが必要です。
    ユーザ様でIDとパスワードがご不明な場合はsupport@patcore.com までお問合せ下さい。

    サポートサイトへのリンク

    support.jpg

    ChemAxonサポートサイト入り口

    SAR>visionサポートサイト入り口

    MassWorksサポートサイト入り口

    ]]>     受託合成～お取引の流れ tag:patcore.chemaxon.jp,2008://1.31 2008-01-01T11:29:57Z 2008-04-12T08:53:33Z 受託合成の最適なパートナーをアレンジ。中国、東欧、インドを利用した合成アウトソーシング admin お取引の流れ～少量化合物合成の例

    以下に少量化合物合成のお取引の流れを以下に示します。ライブラリ合成、その他のプロジェクトについてはinfo@patcore.comまでお問い合わせ下さい。

    秘密保持契約の締結（オプション）

    必要に応じて、弊社と貴社の間で秘密保持契約を締結させて頂きます。
    弊社と各合成パートナーの間ではお客様の秘密情報をカバーする契約を締結しております。

    お見積のご依頼

    ご依頼の際には以下の項目についてinfo@patcore.comまでご連絡下さい。
    折り返し弊社営業担当者よりご連絡申し上げます。

    • 化合物構造式
    • 合成量
    • 純度*
    • 分析データに関するご要望
    • 希望納期
    • 合成ルート（オプション）

    *純度について、HPLC法以外で測定を希望される場合はご指定下さい。また、キラルな化合物の場合については光学純度等についてもご指定下さい。

    分析データはHPLC、１H-NMR、MSのチャートを標準で添付致します。他のご要望が有る場合にはご指示願います。

    確実な合成ルートが既に判明している化合物についてはその情報をお知らせ下さい。

    ご注文

    ご提案内容についてご了承頂いた場合、弊社宛てにご注文書の発行をお願いします。

    納品

    合成完了後、貴社宛てに化合物を送付させて頂きます。

    お支払い

    お見積書に定めたお支払い条件に基づき、代金のご請求をさせて頂きますのでそれに基づいてお支払いをお願い致します。

    ]]>     受託合成:中国・インド・東欧への合成アウトソーシング tag:patcore.chemaxon.jp,2008://1.30 2007-12-31T15:13:28Z 2008-04-12T09:05:57Z admin  

    創薬のアウトソーシング先として急速に発展を続けるインド、中国そして東欧諸国。
    これらの地域への合成アウトソーシングは既に日常的なりました。
    パトコアではより低コスト且つ高品質の受託合成先を常に開拓しております。

    synth_bizmodel.gif

    最適な受託合成機関を活用

    化合物や依頼時期、容量などの条件が異なると最も有利な条件を提示する企業は異なることがよくあります。しかも、その差は決して小さくありません。弊社では中国、インド、東欧の複数の優良合成機関と提携し、その都度ベストな合成パートナーの活用をアレンジ致します。

    ご提案に先立って、まず弊社とお客様との間で機密保持契約を締結して頂きます。次に構造式や純度、納期、分析データなどに関するご要望を弊社にお知らせ頂きます。
    弊社では複数の厳選した受託合成先に打診し、最適な価格条件・納期のパートナーを選別してお客様にご提案致します。 提携先企業と弊社間において、お客様の知的財産や情報保護に関する厳密な契約を締結しておりますので、秘密保持契約を各社と締結することなく、最適な提携先が見つかります。

    １化合物からノーリスクでスタートできます。

    弊社では１化合物mgオーダーからの合成を承ります。リファレンス化合物や中間体、リード化合物の再合成などに最適なサービスです。
    合成ルートが明らかな化合物の場合、納品後のお支払いが基本になります。万一合成できない場合や要求純度に満たない場合、費用は頂きません。

    期間契約（FTE）による戦略的なアウトアウトソーシング

    貴社専属の合成チーム・化学者を一定期間占有する契約（FTE：Full Time Equivalenceベース）を行い、その間にお客様より指示頂いたプロジェクトを実施します。
    一般に3ヶ月以上のプロジェクトにおいて選択され、リード最適化などのプロジェクトを実施します。

    FTEベースの契約を行うことで、さらにコストダウンでき、戦略的な合成アウトソーシングを実現できます。

    サービスの一例

    • 少量化合物合成　数mg　～　数十グラムの合成
    • 化合物ライブラリの合成
    • メディシナルケミストがリードするリード最適化、アナログ合成展開
    • パラレル合成
    • テンプレート及びビルディングブロックの合成
    • リファレンス化合物の合成
    • スケールアップ・プロセス開発研究
    • GMP準拠の合成
    • キロラボ～商用生産
    • 分子設計

    ご提供可能な技術の例

    • 低分子有機化合物の合成
    • キラル合成
    • 炭水化物の合成
    • ペプチド及びペプチド誘導体の合成
    • 危険物質の関与する反応
    • 悪臭の発生を伴う反応
    • アロマタイゼーション（Aromatization）
    • 気相反応（Vapour phase reactions）
    • メチル化（Methylation）
    • アルキル化（Alkylations）
    • 酸化（Oxidations）
    • 水素化（Hydrogenation）
    • 安定同位元素ラベル体合成
    • ライブラリデザイン
    ]]>     SD CheckerEnterprise 法規制対象化合物調査システム tag:patcore.chemaxon.jp,2008://1.29 2007-12-31T15:00:00Z 2008-06-10T16:12:51Z コンプライアンス対応をより確実に、効率的に 今日、法令等の遵守は重要な経営課題の一つと なっておりま... admin コンプライアンス対応をより確実に、効率的に

    今日、法令等の遵守は重要な経営課題の一つと なっております。万一法令等に違反した場合、刑 事罰や行政制裁に加え、企業イメージの悪化や売上の落ち込みなど、経営に大きな影響を及ぼす可 能性があります。
    一方、現実には大量の構造データを規制法令に照 合したり、日々の業務の中で毎回人手により チェックしたりすることは、非効率であり、時に は見落とす恐れも有ります。
    SD Checker Enterprise はこのような問題を解 決するソフトウェアです。本システムを用いる事 で、規制法令に該当する可能性のある構造を簡単 に特定する事ができます。

    SD Checker Enterpriseは企業レベルの法規制構造チェックに対応するため、SOA（サービス指向アーキテクチャ）を採用し電子実験ノートや試薬管理システム等の外部システムとの連携を容易に実現します。

    外部システムから構造チェック要求を 受信すると即座に判定し、チェック結果を応答します。これに より、合成計画立案時や発注処理の過程で警告を発し、違法と なる行為を防止します。

    また、「いつ、だれが、どの構造式をチェックし、その結果が どうであったのか」といった情報がチェック履歴としてサー バーに記録されます。

    対象法規制

    SD CheckerEnterpriseは麻薬及び向精神薬取締法 、覚せい剤取締法、指定薬物、毒物及び劇物取締法、化学兵器禁止法はもちろん、輸出貿易管理令にも対応しており、海外の研究所への化合物送付の際、迅速なチェックが行えます。

    document.gifSDCheckerEnterpriseカタログ(PDF,600KB)

    ]]>     SARvisionPlus（サービジョンプラス） tag:patcore.chemaxon.jp,2008://1.28 2008-01-01T08:46:16Z 2008-06-10T16:44:45Z 大容量データーの詳細な骨格ツリーを生成するSARvision+PLUS SARvision Plus... admin 大容量データーの詳細な骨格ツリーを生成するSARvision+PLUS

    SARvision Plusは、25万化合物迄の化学構造式郡から骨格を自動的に抽出し、フィルタリングやレポート作成などが可能なパワフルなツールです。

    大容量化合物データが取扱えるので、ライブラリの評価などにも利用可能です。 SARvision Plusは通常のSAR>visionの機能加え機能に加えて、 以下の機能を提供致します。

    SAR>vision+PLUSのアドバンテージ

    大容量データの詳細な骨格抽出・マイニング操作が可能

    大量化合物を処理できるだけでなく、 １）任意の属性値を有する化合物についてのみ骨格を抽出する、 ２）任意の部分構造（複数可）を有する化合物だけを対象として処理する、 ３）サンプリング等により、高速処理が実現可能です。

    骨格の操作

    SARvision Plusは、骨格の絞込機能やフォルダを用いた骨格の整理が行えます。

    • 骨格のリングサイズの範囲、骨格を構成するアトムの数などによる骨格の絞込
    • ドラッグ＆ドロップによる骨格のマージ
    • ドラッグ＆ドロップによる骨格の移動
    • フォルダを用いた骨格の整理
    • フォルダー間の論理演算

    動作環境

    • OS：Windows Vista、Windows XP、Windows 2000
    • 推奨メモリー容量： 1GB以上
    • データ取込：SD file、MOL file
    • 構造式編集：ChemDraw (CambridgeSoft)、ISIS/Draw (MDL Information Systems)とのインターフェイス
    • レポート出力：Microsoft Word、EXCELとのインターフェイス
    • データ出力：SD file
    ]]>     SARvision（サービジョン）:骨格認識技術によるSAR解析支援 tag:patcore.chemaxon.jp,2008://1.27 2008-01-01T04:06:34Z 2008-06-10T16:45:40Z 骨格自動認識に基づくSAR（構造活性相関）支援ツール admin savision.jpg

    SARvisionは化学者にとって重要な仕事のひとつである構造活性相関の検討を支援するソフトウェアです。
    独自のケミカルインテリジェンスエンジンにより化学構造データを骨格ごとに分類することができ、SARの検討を容易にします。
    骨格は予めリストとして与える必要はなく、読み込まれた化学構造式からSARvisionのケミカルインテリジェンスエンジンにより自動的に生成されます。
    骨格ベースのデータマイニングにより、化学者の感性に近い評価が行えます。スクリーニングデータの評価やリード最適化の合成戦略の立案などに力を発揮します。

    SARvisionの機能

    • SDファイルから構造式、活性値を読み込みます
    • 構造式群から自動的に骨格を抽出・認識、SAR的に整理されていない化学構造データを自動的に骨格ごとに分類
    • 活性データなどでソート、絞込みが可能
    • 活性データがある骨格を瞬時に認識
    • 共通構造と置換基を整理しRグループテーブルを瞬時に作成
    • RグループテーブルをMicrosoft EXCELやWORDやへ出力しレ効率的にポートを作成
    • コマンドラインオプションをサポートしており、他のソフトウエアとの連携も可能

    物性値（プロパティー）の計算

    SARvision Plusは、基本的な物性値の計算機能を提供いたします。ADME予測やルピンスキーのRule of 5に基づく評価が手軽に行えます。

    • HBA:Hydrogen Bond Acceptors
    • HBD: Hydrogen Bond Donors
    • MW: Molecular Weight
    • PSA: Polar Surface Area
    • logP: Octananol/Water partition coefficient
    • RotBonds: number of rotatable bonds.
    ]]>     MassWorksソリューション紹介 tag:patcore.chemaxon.jp,2008://1.26 2008-01-01T11:00:00Z 2008-04-12T10:08:13Z MassWorks活用事例のご紹介 admin 定性分析 (LC/MS/MS or LC/MS)

    定量分析

    メタボロミクス、メタボライト同定

    プロテオミクス

    バイオマーカー探索

    安全保障

    環境分析、石油化学分析

    ]]>     MassWorks参考文献リンク tag:patcore.chemaxon.jp,2008://1.25 2008-01-01T14:00:00Z 2008-04-12T09:57:44Z MassWorks参考文献 admin アプリケーションノート

    技術資料

    論文リスト

    AMS2006発表資料

    ]]>     MassWorks(マスワークス）：質量分析で組成式決定を容易に tag:patcore.chemaxon.jp,2008://1.24 2008-01-01T02:23:06Z 2008-04-12T09:57:00Z 四重極で組成式決定を可能に。質量数精度を最大で100倍に改善。 admin MassWorks(マスワークス）を用いると四重極ユニットマスで組成式決定ができるようになり、質量数精度を最大で100倍に改善します。

    MassWorksは、Cerno社の特許技術MSIntegrityに基づく使い易いマススペクトル解析ソフトウエアです。 MassWorksは強力なキャリブレーション技術「MSIntegrity」を統合した幅広い用途に使える軽快なソフトで、質量数精度を最大で100倍に改善します。 MassWorksは、斬新なキャリブレーション技術と確固たる数学原理の組み合わせによって、マスデータを大幅に改善します。

    MassWorksは独自の技術により得られた高精度な質量データからさらにCLIPSテクノロジーによって組成式の決定を革新的に容易にします。

    MassWorksにより得られる効果

    • 質量数精度の向上：最大100倍
    • 実効ノイズ除去：最大3倍
    • 再現性の向上：3倍以上
    • バイアスの無いベースライン補正
    • 曖昧さの無いパラメータ不要のピーク位置決定
    • スペクトルアライメントの自動化

    質量分析による組成式決定を革命的に改善

    MassWorksは組成式決定支援技術 CLIPS(Calibrated Lineshape Isotope Profile Search) を組み込んでおり、通常では非常に高額の装置でのみ可能となる組成式の決定による正確な化合物同定が四重極質量分析装置で可能になります。

    また、MassWorksはTOFやIonTrapなど高分解能マススペクトロメーターについては、標準サンプル無しに、CLIPSを利用できる新しいテクノロジーsCLIPSが利用できます。たとえ超高分解能の質量分析装置でも、得られる組成式決定に利用可能なデータは質量数のみですが、sCLIPSを利用すると、理論スペクトルとの一致度により確度の高い組成式の決定が行えます。

    ピッツバーグカンファレンスにおいて銅賞を受賞

    MassWorskは2006年度ピッツバーグカンファレンスにおいて、分析科学をカバーする主力ジャーナル編集者（数十人）の投票により「最も創造的な製品」に対する銅賞(3位)を授与されました。

    MassWorksに対応する質量分析装置

    MassWorksは以下の質量分析ソフトに対応しております。（2008年1月現在）

    • ABI/MDS Sciex:Analyst1.4以上
    • Agilent:Chemstation D.02以上
    • PerkinElmer:TurboMass、MassLynx4.0以上
    • Thermo Fisher:Xcalibur 1.4以上
    • Varian:MS WorkStation、Saturn GCMS Workstation
    • Waters:MassLynx4.0以上

    MASSWORKSのトライアル

    お客様の機器のデータで是非MassWorksの効果をお試し下さい。お預かりしたデータから正確な質量または組成式をブラインドで計算致します。
    まずは info@patcore.comまで御連絡下さい。折り返しサンプルデータ準備方法についてご連絡させて頂きます。

    MassWorksオンラインセミナー

    ［MassWorksオンラインセミナー]をクリックして頂くとオンラインセミナーがご覧いただけます。 massworks.png

    ]]>     宇宙実験による高分解能蛋白質結晶生成サービス tag:patcore.chemaxon.jp,2008://1.22 2007-12-31T16:20:35Z 2008-04-12T09:08:16Z 高分解能蛋白結晶を宇宙空間で生成 微小重力環境では対流や沈降が抑えられるため、高分解能なタンパク質... admin 高分解能蛋白結晶を宇宙空間で生成

    iss.jpg微小重力環境では対流や沈降が抑えられるため、高分解能なタンパク質結晶が生成します。

    宇宙で結晶化の実例

    電子密度の精密化

    アミラーゼの結晶 宇宙で生成したアルファアミラーゼ結晶は0.89Å分解能を示しました。得られた電子密度図から得られる立体構造情報は、地上実験のものと比べて飛躍的に多く、水素結合の様子まで明らかになります。

    クラスター化の抑制

    cluster.jpg 宇宙実験ではクラスター化が抑制されます。その他、宇宙では構造解析の妨げとなるツイン構造の解消や、異なる晶系の結晶生成などが観察されます。（下図：クラスター化した地上結晶）

    超高分解能のメリット

    X線回折実験で1.0Åをきるような超高分解能結晶からは、目的タンパク質の3次元分子構造が詳細にわかるため、効率のよい創薬や構造機能解明に役立ちます。

    宇宙実験に適した試料

    特に試料の精製度が高く、すでに地上で結晶が得られている試料の場合、宇宙実験で高分解能結晶の生成が期待されます。（これまで75％以上の確率で分解能が改善しています。）

    試料の受付からX線データ取得まで総合的にサポート

    ご提供可能サービス

    • タンパク質試料の調製
    • 結晶化条件の最適化
    • 宇宙での結晶生成
    • X線回折データの取得
    • 高精細構造解析
    • リガンド化合物の探索・合成 等

    地上で結晶化がうまくいかないタンパク質試料の結晶化改善方法も提案・受託しております。また、工程単位でのサービスもご提供します。詳細はご相談ください。

    スケジュール

    ロシアのプログレス補給船を使用し、年2回のコンスタントな宇宙実験機会をご提供します。 国際宇宙ステーションのロシアサービスモジュール内で2～3ヶ月間、微小重力環境下で結晶を生成させます。

    高品質タンパク質結晶生成までの流れ

    Step 1 性状・結晶化事前確認

    お客様から申し込まれたタンパク質試料について、性状の確認と、結晶化条件最適化のための事前確認を行います。宇宙実験で分解能の改善が見込めそうな試料を見極めます。

    Step 2 宇宙実験向け結晶化条件の最適化

    結晶化条件を最適化し、宇宙実験用結晶化容器での結晶生成を確認します。

    Step 3 宇宙実験の実施

    国際宇宙ステーションにて宇宙実験を実施し、結晶を生成します。

    Step 4 生成結晶の取出し、凍結、X線回折データの取得

    X線回折実験向けの結晶の場合には、生成した結晶を取り出し、凍結し、放射光実験施設で回折データを取得します。取得した回折データが、あらかじめ設定した目標に達した場合、お客様にデータをお引き渡しします。

    ]]>     ヒト組織サンプル御見積リクエスト tag:patcore.chemaxon.jp,2008://1.21 2008-01-01T03:10:04Z 2008-04-12T08:40:12Z 以下の御見積リクエストフォームに必要事項をご記入の上送信下さい。 お客さま情報 貴社名（必須）: ご... admin 以下の御見積リクエストフォームに必要事項をご記入の上送信下さい。


    お客さま情報

    Global RepositoryR サンプル情報





    ]]>     ヒト組織サンプル（組織・血清・DNA/RNA） tag:patcore.chemaxon.jp,2008://1.20 2007-12-31T16:01:01Z 2008-04-12T08:39:07Z BioServ社Global Repository™ NCIの研究者により1989年に設立された本... admin BioServ社Global Repository™ Human-Tissue.jpg

    NCIの研究者により1989年に設立された本バイオバンク(旧Genomics Collaborative)は、50万以上のサンプルを提供する世界最大級のヒト組織バンクで、これまで、20カ国、600社以上との取引実績を有します。
    提供されるサンプル提供と共にデモグラフィーデータと各疾病に関連する詳細な診断データ、臨床データが付属致します。バイオマーカーの探索などヒト組織を用いた研究は創薬に不可欠な要素となってきております。

    組織サンプルの御見積のご依頼は［見積依頼フォーム]よりお願い致します。

    疾患種別

    炎症疾患
    RA、OA、喘息、多発性硬化症、乾癬、市中肺炎
    敗血症、全身性エリテマトーデス
    心臓血管系疾患
    冠動脈疾患、高血圧、脂質代謝異常
    2型糖尿病
    肥満
    がん
    乳がん、大腸がん、前立腺がん、卵巣がん、その他
    正常サンプル

    糖尿に関するアノテーション情報の一部

    • Blood Glucose Level at diagnosis
    • Re-established blood glucose level
    • Diabetic Med for re-established dx
    • Fasting Level
    • Most recent fasting blood glucose level
    • Most recent random glucose level
    • Most recent HbA1c value
    • GH Med1
    • How Often do they Monitor Glucose
    • When was last visit to Diabetes Speciali
    • Specific Diet Y/N
    • Specific Exercise Y/N
    • PI visit for diabetes in past year
    • Dialysis Type
    • Diabetic Conditions
    • Labs Reports
    ]]>     結晶支援サービスC-Platform tag:patcore.chemaxon.jp,2008://1.19 2007-12-31T16:32:34Z 2008-02-21T08:54:55Z 弊社ではコンフォーカルサイエンス株式会社、株式会社丸和栄養食品と提携し、結晶化に関する包括的なソリュ... admin 弊社ではコンフォーカルサイエンス株式会社、株式会社丸和栄養食品と提携し、結晶化に関する包括的なソリューションサービスC-Platformをご提供致します。ＪＡＸＡ宇宙実験（ＪＡＸＡ－ＧＣＦプロジェクトの技術支援を通して、400種類以上のタンパク質試料の取扱い経験をベースとした豊富な経験に基づきお客さまの問題解決にあたります。

    サービスの特長

    • 高分解能のタンパク質結晶生成を指向
    • スクリーニングに頼らない独自の技術で、結晶化条件を効率的に絞り込
    • 1Å回折分解能を切る高分解能の結晶生成の経験が豊富
    • カウンターディフュージョン法（液々拡散法）による結晶化を利用した迅速なソーキング
    • 大型放射光施設（PSI/SLS スイス）でタイムリーにデータを取得
    • 世界唯一の商用宇宙実験を実施
    • 丁寧な情報のフィードバックにより確実に次のステップにつなげます
    ]]>     法規制物質判定システムSDChekerEnterpriseの販売を開始 tag:patcore.chemaxon.jp,2008://1.16 2007-07-01T09:04:17Z 2008-03-29T10:05:03Z パトコア株式会社（本社：東京都江東区　代表　藤木雅己）は構造式から法規制化合物を特定し、全社的なコン... admin パトコア株式会社（本社：東京都江東区　代表　藤木雅己）は構造式から法規制化合物を特定し、全社的なコンプライアンス対応を支援するシステム『SDChecker Enterprise』の販売を開始致しました。
    今日、法令等の遵守は重要な経営課題の一つとなっております。万一法令等に違反した場合、刑事罰や行政制裁に加え、企業イメージの悪化や売上の落ち込みなど、経営に大きな影響を及ぼす可能性があります。
    一方、現実には大量の構造データを規制法令に照合したり、日々の業務の中で毎回人手によりチェックしたりすることは、非効率であり、時には見落とす恐れも有ります。SD Checker Enterprise はこのような問題を解決するソフトウェアです。本システムを用いる事で、規制法令に該当する可能性のある構造を簡単に特定する事ができます。

    全社的な規制対応への取り組みを支援

    SD Checker Enterpriseは企業レベルの法規制構造チェックに対応するため、SOA（サービス指向アーキテクチャ）を採用し電子実験ノートや試薬管理システム等の外部システムとの連携を容易に実現します。外部システムから構造チェック要求を受信すると即座に判定し、チェック結果を応答します。これにより、合成計画立案時や発注処理の過程で警告を発し、違法となる行為を防止します。

    主要な国内法規制データベースを標準装備

    SD Checker Enterpriseには専用の規制データベースが付属します。規制データベースには「麻薬及び向精神薬取締法」、「覚せい剤取締法」、「指定薬物」、「毒物及び劇物取締法」、「輸出貿易管理令」をカバーしており、すぐにご利用頂けます。また、ユーザー自身で規制データを登録して頂くことも可能です。
    弊社では、規制データのアップデートサービス、お客様個別のご要望に対応した規制データベースの構築サービスもご提供しております。

    会社概要


    名称：パトコア株式会社
    本社住所：東京都江東区有明3-1-25有明フロンティアビルB棟9階
    代表者：取締役　藤木雅己
    ホームページ:http://www.patcore.com

    【本件に関するお問い合わせ先】
    担当者：有賀(あるが)
    TEL：03-5530-9242
    E-mail：info@patcore.com

    ]]>     米国CernoBioscience社『MassWorks』の販売を開始 tag:patcore.chemaxon.jp,2007://1.15 2007-03-01T08:49:38Z 2008-02-16T09:01:42Z 質量分析の性能を飛躍的にアップする革新的ソフト！ パトコア株式会社（本社：東京都江東区　取締役　藤木... admin 質量分析の性能を飛躍的にアップする革新的ソフト！

    パトコア株式会社（本社：東京都江東区　取締役　藤木雅己）は米国Cerno Bioscience LLCと代理店契約を締結し、質量分析装置の性能を飛躍的に向上するソフトウエア『MassWorks』の販売を開始いたしました。

    MassWorksは、Cerno社の特許技術MSIntegrityに基づく使い易いマススペクトル解析ソフトウエアで質量数精度を最大で100倍に改善します。

    今回発売を開始するする『MassWorks』は、次の通りである。

    MassWorksの特長

    MassWorksを用いると、廉価でよくルーチンにも使われる四重極質量分析装置で数倍高額な機器に匹敵する質量精度を得られるようになり、組成式の決定を可能にします。

    MassWorksは以下のような性能向上をもたらします。

    • 組成式決定を革命的に改善
    • 質量数精度を最大で100倍に改善
    • 検出限界を改善(最大でS/N比を3倍に改善）

    商品の仕様

    会社概要

    • 名称：パトコア株式会社
    • 本社住所：東京都江東区有明3-1-25有明フロンティアビルB棟9階
    • 代表者：藤木雅己
    • ホームページ:http://www.patcore.com

    【本件に関するお問い合わせ先】

    担当者：有賀(あるが)
    TEL：03-5530-9242
    E-mail：info@patcore.com


    ]]>     無料で使える化学構造式管理ソフトInstantJChem2.2がリリース tag:patcore.chemaxon.jp,2008://1.14 2008-02-16T07:45:36Z 2008-03-29T09:57:53Z ケモインフォマティックスのリーディング企業であるChemAxonより、無料で使える化学構造式の管理ソ... admin ケモインフォマティックスのリーディング企業であるChemAxonより、無料で使える化学構造式の管理ソフト InstantJChem2.2がリリースされました。
    Instant JChemはSDファイルをインポートし、化学構造式のデータベースを作成し、構造式による検索が行えるシステムで、個人的な利用に限らず無料でお使い頂けます。
    ただし、他のJChemデータベースへアクセスしたり、データベースを共有するような場合は有料となります。
    Instant JChemでは以下のような事が手軽に行えます。
     
    ・SDファイル、RDファイルからデータベースの作成、フォームの作成
    ・構造描画によるデータの追加
    ・部分構造、類似構造による検索
    ・付随データによる検索
    ・データベース内、データベース間の構造の重複チェック

     以下よりダウンロードできますので、どうぞご利用下さい。
     
      http://www.chemaxon.com/product/ijc.html

     弊社にて日本語マニュアルも用意しております。ご入用の方はinfo@patcore.comまで御連絡下さい。


    パトコア株式会社
    電子メール： info@patcore.com
    ホームページ：http://www.patcore.com
    〒135-0063 東京都 江東区 有明3-1-25
    有明フロンティアビル B棟9階
    TEL:03-5530-9242　FAX:03-5530-9241

    ]]>     化学情報システムのコンサルタント、サポートスタッフを募集 tag:patcore.chicappa.jp,2008://1.11 2008-04-08T08:45:00Z 2008-04-12T08:17:00Z 現在以下の職種について募集を行っております。 仕事内容 化学情報システムに関するコンサルティング及び... admin 現在以下の職種について募集を行っております。
    仕事内容
    化学情報システムに関するコンサルティング及びサポート業務
    化学情報システムのドキュメント作成
    求める経験・スキル
    科学系システムの開発/運用
    英語力（英検2級程度）
    勤務地
    東京（在宅勤務相談可）
    雇用形態
    １）正社員、２）契約社員、パートタイムなどご相談に応じます。
    休日/休暇
    休日：完全週休二日制（土曜日、日曜日）、祝日、年末年始
    休暇（正社員）：有給休暇、各種慶弔休暇など
    給与
    経験・能力に基づき優遇いたします
    応募資格
    年齢：35歳位まで

    お問合せは、 info@patcore.comまでお願いします。



    ]]>